Die Biotopkartierung liefert wichtige Grundlagen für den Naturschutz und trägt dadurch wesentlich zur Erhaltung der ökologisch wertvollen Landschaftsbestandteile bei.
Die Biotope werden im Gelände in Karten eingezeichnet und dazu ihre wichtigsten Eigenschaften und Merkmale beschrieben.
Die Biotope werden in verschiedene Biotoptypen unterteilt, die sich aufgrund ihrer Gelände- und Standorteigenschaften, dem Vorkommen von Pflanzenarten und ihren Lebensgemeinschaften sowie ihrer Entstehung voneinander unterscheiden. Bei diesen Biotoptypen handelt es sich zum einen um natürlich entstandene Flächen wie Hochmoore sowie zum anderen um Gebiete, die aufgrund früherer landwirtschaftlicher Nutzung (z.B. Hecken und Streuwiesen) oder als Folge von Rohstoffgewinnung (z.B. Abbaustellen) entstanden sind.
Insgesamt wurden im Landkreis Mühldorf 1.306 Biotope erfasst, dies sind 2,7 % der Landkreisfläche. Die genaue Lage der Biotope kann im Internet mit FIS-Natur aufgerufen werden. Bereitgestellt werden die Daten vom Bayerischen Landesamt für Umwelt (LfU).
Die erste Biotopkartierung fand bereits in den 90er Jahren statt, der zweite Durchgang im Zeitraum 2008 – 2010.
